Cancers pédiatriques : pourquoi 350 échantillons comptent en Île-de-France

À Paris et dans le Val-de-Marne, plus de 350 échantillons de cancers pédiatriques ont désormais été réunis dans une même ressource de recherche. Le nombre paraît modeste face aux grandes cohortes médicales. Pour les cancers de l’enfant, il dit au contraire quelque chose du problème à résoudre.

En France, environ 2 300 enfants et adolescents sont diagnostiqués chaque année, tous cancers confondus. L’INCa estime à 2 260 le nombre annuel moyen de nouveaux cas sur la période 2014-2020. Dès que les chercheurs s’intéressent à un type précis de tumeur, les effectifs disponibles se réduisent donc rapidement.

Paris Kids Cancer met en commun des ressources provenant d’établissements qui disposaient déjà séparément de patients, de prélèvements et de compétences. L’alliance associe notamment l’Institut Curie et plusieurs hôpitaux de l’AP-HP à Paris, ainsi que Gustave Roussy à Villejuif et l’hôpital Bicêtre au Kremlin-Bicêtre.

Le progrès annoncé à mi-parcours tient d’abord à l’organisation de cette matière scientifique. Le programme Tumor Stream doit permettre aux échantillons biologiques et aux données qui les décrivent de circuler entre services hospitaliers et équipes de recherche selon des circuits communs. Trois pilotes sont désormais déployés autour des tumeurs osseuses, des tumeurs rhabdoïdes et des tissus fœtaux hématopoïétiques.

Cette infrastructure alimente notamment un Atlas Pan-Cancer pédiatrique, qui rassemble maintenant plus de 350 échantillons. Ils doivent être étudiés notamment par transcriptomique à cellule unique, une méthode qui mesure l’activité des gènes cellule par cellule. Au lieu d’observer une tumeur comme un bloc, les chercheurs peuvent ainsi distinguer les populations cellulaires qui la composent et explorer leurs liens avec le développement ou le système immunitaire. À ce stade, les 350 échantillons constituent une ressource à analyser, pas un résultat thérapeutique.

CLIP-ON vise une étape plus proche du soin. Paris Kids Cancer présente le 1er octobre, devant un comité international mandaté par l’INCa, ce projet consacré aux biopsies liquides. L’idée est d’exploiter l’ADN tumoral circulant dans les prélèvements biologiques pour aider au diagnostic moléculaire, suivre la maladie résiduelle, détecter un risque de rechute ou mesurer la réponse aux traitements.

La recherche sur les biopsies liquides progresse en oncologie pédiatrique, mais leur utilisation clinique demande encore des méthodes standardisées et des validations selon les tumeurs.

À mi-parcours, la nouveauté francilienne n’est donc pas une nouvelle molécule. Elle se trouve dans la capacité à traiter Paris, Villejuif et Le Kremlin-Bicêtre comme les différentes pièces d’un même outil de recherche. Les trois circuits pilotes et les 350 échantillons montrent que cet outil commence à prendre forme. L’évaluation de CLIP-ON constitue maintenant la prochaine étape vers une utilisation plus proche de la clinique.