À Saint-Contest, LABÉO repère chez un poulain un gène de résistance aux antibiotiques

À Saint-Contest, LABÉO a détecté le gène erm46 dans le liquide respiratoire d’un poulain. Normandie Équine Vallée présente cette identification comme la première en France chez une souche de Rhodococcus equi. Le résultat intéresse directement la médecine équine : erm46 confère à cette bactérie une résistance aux macrolides, des antibiotiques utilisés contre la rhodococcose.

Cette infection touche surtout les poulains âgés de 1 à 6 mois et peut provoquer des pneumonies avec abcès pulmonaires. Une fois le diagnostic établi, l’Institut français du cheval et de l’équitation indique que le traitement associe généralement un macrolide à la rifampicine. Repérer erm46 revient donc à identifier un mécanisme capable de compromettre l’une des deux armes habituelles du traitement.

Le lien entre ce gène et la résistance est bien établi. Dès 2015, des chercheurs l’avaient retrouvé dans l’ensemble des souches résistantes aux macrolides d’une collection de 124 isolats cliniques étudiés aux États-Unis. Son introduction dans une souche sensible suffisait à provoquer un niveau élevé de résistance à cette famille d’antibiotiques.

La détection calvadosienne ne permet toutefois pas, à elle seule, de classer la souche parmi les Rhodococcus equi multirésistants qui préoccupent les chercheurs à l’étranger. Le clone MDR-RE 2287, apparu dans des élevages américains puis identifié en Irlande dès 2016 et plus récemment au Japon, cumule erm46 avec une mutation apportant une résistance à la rifampicine. Les données rendues publiques sur le cas français ne précisent pas si cette seconde résistance a été recherchée ni si la souche a été séquencée.

Le résultat relève donc du diagnostic appliqué à un prélèvement clinique, pas d’une nouvelle thérapie ou d’une découverte fondamentale. À Saint-Contest, le même site réunit LABÉO, l’unité BioTARGen de l’Université de Caen Normandie et le Réseau d’épidémiosurveillance en pathologie équine, autour du diagnostic, de la recherche et de la surveillance des maladies du cheval.

À Saint-Contest, ce marqueur de résistance déjà suivi dans plusieurs grands pays d’élevage peut désormais être repéré sur un prélèvement de poulain. Les données publiées ne disent pas encore si cette souche résiste aussi à la rifampicine ni comment elle se rattache aux lignées multirésistantes observées à l’étranger.